COVID19 wiki – Intrebări si răspunsuri: mutatiile COVID19

COVID19 wiki – Intrebări si răspunsuri: mutatiile COVID19

Timp de citire estimat: 5 minut(e)

Au fost descoperite mutații pentru SARS-CoV-2, virusul care cauzează boala coronavirusului 2019 (COVID-19)?

O nouă variantă de virus apare atunci când virusul dezvoltă una sau mai multe mutații care îl diferențiază de variantele predominante de virus care circulă într-o populație. Supravegherea CDC a variantelor SARS-CoV-2 include cazuri US COVID-19 cauzate de variante. Site-ul include, de asemenea, care mutații sunt asociate cu anumite variante. CDC a lansat un tablou de bord de supraveghere genomică și un site web care urmărește tendințele cazurilor SUA COVID-19 cauzate de variante. Cercetătorii studiază modul în care variantele pot sau nu să modifice gradul de protecție prin vaccinurile disponibile și terapiile orientate către anticorpi.
Mutații

Mutațiile virale pot apărea în mod natural oriunde în genomul SARS-CoV-2. Spre deosebire de genomul ADN-ului uman, care se mută lent, virușii ARN sunt capabili să mute ușor și rapid. O mutație poate modifica funcția virală (de exemplu, poate îmbunătăți legarea receptorilor) sau poate să nu aibă funcție discernabilă.

Au fost identificate mutații pentru domeniul de legare a receptorilor (RBD) pe proteina spike a SARS-CoV-2. Mai multe dintre aceste mutații prezintă o afinitate de legare mai mare la ACE2 uman, probabil datorită stabilizării structurale îmbunătățite a RBD. Dacă o mutație îmbunătățește transmiterea virală este o întrebare de explorat. Posibilele mecanisme de transmisibilitate crescută includ vărsarea virală crescută, intervalul contagios mai lung, creșterea infectivității sau stabilitatea mediului.

Mutație D614G

La începutul lunii mai 2020, un studiu realizat de Korber și colegii [81] a raportat apariția unei mutații SARS-CoV-2 (Spike D614G), una dintre mai multe mutații Spike (S) care au fost descoperite. Infecțiile cu SARS-CoV-2 cu această mutație au devenit descendența virală dominantă în America de Nord, Europa și Australia. Semnificația mutației D614G în termeni de factori precum transmisibilitatea, virulența, antigenicitatea și rezistența potențială la tratament este slab înțeleasă. [82]

Cercetările ulterioare privind mutația proteinei D614G au sugerat acum un câștig în fitness și eficacitate a transmisiei. [83] O analiză a datelor britanice, mutația 614G părea să confere un avantaj selectiv. Nu a existat nicio indicație că pacienții infectați cu varianta Spike 614G au o mortalitate COVID-19 mai mare sau o severitate clinică, dar 614G este asociat cu o încărcătură virală mai mare și o vârstă mai tânără a pacienților care ar putea conduce la diferite dinamici de transmitere. [84]

Mutațiile din proteina SARB CoV-2 spike RBD sunt monitorizate deoarece au potențialul de a reduce eficacitatea anticorpilor neutralizanți. Lucrările recente s-au concentrat pe expunerea la terapia cu anticorpi monoclonali care conduc selecția mutanților rezistenți. [85] S-au găsit variante virale care rezistă neutralizării care circulă în mediu [86] și au fost selectate prin utilizarea serurilor convalescente într-un cadru clinic. [87]
Variante

După cum sa menționat, viruși precum SARS-CoV-2 se schimbă. Dintre sutele de variante detectate în primul an al pandemiei, cele mai preocupante sunt așa-numitele variante de îngrijorare (COV). Variantele pot afecta eficacitatea vaccinurilor și a terapiilor orientate către anticorpi.

VOC – 202012/01 (linia SARS-CoV-2 B.1.1.7)

CDC urmărește proporțiile variantelor care circulă în Statele Unite și estimează că varianta B.1.1.7 (detectată pentru prima dată în Regatul Unit) a reprezentat peste 44% din cazuri în perioada 2 ianuarie – 27 martie 2021. La 7 aprilie 2021, CDC anunțat B.1.1.7 este tulpina dominantă care circulă în Statele Unite.

S-a dovedit că o nouă mutație de vârf cu deleții de (delta) 69 / delta (70) apare de novo de mai multe ori și se menține prin transmisie susținută în asociere cu alte mutații. [88] Aceasta este sursa unui control intens în Europa, în special în Regatul Unit. Un VOC recent – 202012/01 (201 / 501Y.V1) conține ștergerea 69-70, precum și alte câteva mutații, inclusiv: N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H. Varianta este investigată ca o cauză a creșterii rapide a numărului de cazuri posibil datorită creșterii încărcăturilor virale și a transmisibilității. Mutația N501Y pare să crească încărcăturile virale cu 0,5 log. [89]

În plus, VOC-202012/01 are mutații care par să explice transmisia sa îmbunătățită. S-a demonstrat că înlocuirea N501Y a proteinei spike crește legarea ACE2 și infectivitatea celulelor la modelele animale. Ștergerea la pozițiile 69 și 70 a proteinei spike (delta69-70) a fost asociată cu eșecul testului de diagnostic pentru sonda ThermoFisher TaqPath care vizează proteina spike. Prin urmare, laboratoarele britanice folosesc acest eșec al testului pentru a identifica varianta. [90]

Datele de supraveghere din testarea comunității naționale din Marea Britanie („Pilonul 2”) au arătat o creștere rapidă a eșecurilor țintei genei S (SGTF) în testarea PCR pentru SARS-CoV-2 în noiembrie și decembrie 2020. R0 al acestei variante pare mai mare. În același timp în care transmisia virusului de tip sălbatic scădea, varianta a crescut, sugerând că aceleași recomandări (de exemplu, măști, distanțare socială) s-ar putea să nu fie suficiente. Varianta britanică infectează, de asemenea, mai mulți copii (cu vârsta de 19 ani și mai mici) decât tipul sălbatic, indicând faptul că poate fi mai transmisibil la copii. Acest lucru a ridicat îngrijorări, deoarece până acum a fost observată o relativă scutire de copii. Se presupune că această variantă are o legătură ACE mai puternică decât varianta originală, care s-a simțit că are probleme la infectarea indivizilor mai tineri, deoarece aceștia exprimă ACE într-un grad mai mic. [90]

Alte COV

Supravegherea genomică îmbunătățită în unele țări a detectat alte COV, inclusiv B.1.351 (501Y.V2) detectate pentru prima dată în Africa de Sud și B.1.1.28 (redenumit P.1) (501Y.V3) care a fost detectat la 4 călători din Brazilia în timpul screening-ului de rutină pe aeroportul din Tokyo. [91]

COV din Africa de Sud

Mutația E484K a fost găsită inițial în variantele din Africa de Sud și Brazilia la sfârșitul anului 2020 și a fost observată în varianta Regatului Unit la începutul lunii februarie 2021.

Mutațiile poziției 484 și 501 care sunt ambele prezente în varianta sud-africană, iar combinația este îngrijorată de faptul că poate apărea evadarea imună. Aceste mutații, printre altele, s-au combinat pentru a crea COV B.1.351. Mutația în poziția 501 schimbă forma RBD prin rotirea acestuia cu 20 de grade pentru a permite o legare mai profundă. Mutația în poziția 484 schimbă RBD într-o sarcină pozitivă și permite o afinitate mai mare față de receptorul ACE2. [92]

COV din Brazilia

Sabino și colab. Descriu reapariția COVID-19 în Manaus, Brazilia în ianuarie 2021, în ciuda unei seroprevalențe ridicate. Un studiu al donatorilor de sânge a indicat că 76% din populație a fost infectată cu SARS-CoV-2 până în octombrie 2020. Spitalizările pentru COVID-19 în Manaus au fost de 3.431 în perioada 1-19 ianuarie 2021 comparativ cu 552 în perioada 1-19 decembrie, 2020. Spitalizările au rămas stabile și scăzute timp de 7 luni înainte de decembrie. Câteva variabile postulate cu privire la această reapariție includ titruri în scădere la linia virală originală și prevalența ridicată a variantei P.1, care a fost descoperită pentru prima dată în Manaus. [93] În plus, cercetătorii monitorizează apariția unei a doua variante în Brazilia, P.2, identificată în Rio de Janeiro. Începând cu 15 aprilie, CDC listează P.2 ca variantă de interes.

COV din California

COV B.1.427 și B.1.429 au apărut în California. Aceste variante au reprezentat 2,9% și 6,9% din variantele care circulă în Statele Unite în perioada 2 ianuarie – 27 martie 2021.

Cercetătorii studiază modul în care variantele pot sau nu să modifice gradul de protecție prin vaccinurile disponibile și terapiile orientate către anticorpi.

Daniel Ganea
Vino cu mine

Faci un comentariu sau dai un răspuns?

Adresa ta de email nu va fi publicată. Câmpurile obligatorii sunt marcate cu *

19 − seven =

Acest site folosește Akismet pentru a reduce spamul. Află cum sunt procesate datele comentariilor tale.

 ConsultatiiLaDomiciliu.ro
Social Media Auto Publish Powered By : XYZScripts.com